Tô com as mesmas perguntas que você, amigo.
Vou fazer um intercâmbio de 1 mês em Los Angeles e, no fim, vou passar uns 4 dias em San Diego. Pelo que li (e perguntei pra família que vai me hospedar em LA) o meio mais seguro é viajar de trem mesmo. Entra no http://www.amtrak.com/ que lá acho que vc consegue tirar a maioria das dúvidas (e já agendar sua passagem, ver preços, etc).