Oi Stefi, eu e meu marido também estamos planejando uma viagem para a Patagônia, mas em dezembro. Andei pesquisando bastante sobre o que visitar na Patagônia, e já fiz e desfiz nosso roteiro umas dez vezes, hehe! Mas vamos lá, vou tentar te passar o que eu acho que vale a pena visitar:
El Calafate: a principal e praticamente única atração é o Glaciar Perito Moreno. Acredito que se você for fazer o passeio Big Ice e o passeio de barco a todos os glaciares uns 3 dias seja suficiente. 1 dia para chegar, fazer check-in, comprar os passeios, etc. 1 dia para o Big Ice e 1 dia para o passeio de barco.
Ushuaia: Uns 4 dias acredito que seja mais que o suficiente. Sobre os passeios, há o paqrque nacional Terra do Fogo, o Cerro Martial, o passeio pelo Canal Beagle, os lagos Fagnano e Escondido, o museu do presídio, etc.
Sobre Buenos Aires não pesquisei nada, pois não vou para lá, hehe!
Espero que tenha ajudado